A Era Paleozóica, que marcou o aparecimento de quase todos os filos animais dentro de alguns milhões de anos, terminou com uma extinção em massa. A extinção em massa foi o oposto virtual do que começou a era, com mais de 90 por cento da vida do mundo sendo exterminada. A recuperação dessa extinção em massa levou quase 30 milhões de anos.
Existem muitas subseções na Era Paleozóica, dividindo os milhões de anos em pedaços menores. O fim da era Paleozóica é chamado de era Permiana. Esta era viu inúmeras mudanças climáticas, juntamente com flutuações nos níveis de dióxido de carbono e oxigênio. Existem inúmeras hipóteses sobre o que causou a extinção no final da era Permiana, incluindo o sulfato de hidrogênio liberado pelo mar, um enorme meteoro na Antártida ou mesmo todas as possibilidades combinadas em uma.
