A principal forma pela qual o sistema endócrino afeta o sistema excretor é controlando a quantidade de água liberada com a urina. O sistema endócrino libera uma série de hormônios para fazer com que os rins reabsorvem a água da urina quando os níveis de água no sangue estão baixos.
O hipotálamo monitora os níveis de eletrólitos no sangue. Uma concentração crescente de eletrólitos indica desidratação, enquanto uma concentração mais baixa pode indicar hidratação excessiva. As causas mais comuns de desidratação são a ingestão inadequada de água, transpiração excessiva e perda de sangue. Quando o hipotálamo detecta que o corpo está desidratado, ele produz o hormônio antidiurético que é então transferido e liberado pela glândula pituitária.
O hormônio antidiurético circula pelos rins, onde aumenta a taxa de reabsorção de água. Ele faz isso fazendo com que os rins formem canais de água nos túbulos que passam pelos rins. A água fluindo de volta para a corrente sanguínea causa uma redução no hormônio antidiurético até que os canais sejam fechados novamente.
Outro hormônio que regula a maneira como os rins absorvem água é a aldosterona, produzida pelas glândulas supra-renais. A aldosterona muda a maneira como o corpo lida com substâncias químicas dissolvidas para afetar como a água é absorvida pelos rins.