A National Geographic especula que o Monte Fuji está desenvolvendo uma grande reserva de magma basáltico com base em um aumento nos terremotos observados pela primeira vez no início dos anos 2000. O calor e o gás trazidos à superfície pelo magma basáltico causam esses terremotos.
A força destrutiva da erupção de 1707 pode ter alterado a estrutura interna do vulcão, o que significa que ele pode conter atualmente um tipo de magma diferente do que continha no passado, quando o vulcão entrou em erupção com certa regularidade a cada 30 anos. O governo japonês teme que a atual dormência da montanha esteja permitindo que ela se acumule em um tipo mais explosivo de magma.