Cada aminoácido é feito de três códigos de tripletos de base chamados códons. Os códons são compostos por três combinações de quatro nucleotídeos disponíveis. Existem 64 combinações potenciais de códons.
Quais códons são usados determinam o tipo de aminoácido criado. A ordem dos códons na sequência tripla determina qual proteína é criada. Sessenta e uma das 64 combinações criam os aminoácidos nas proteínas. As combinações restantes criam as sequências de término ou parada da cadeia. Vários códons, chamados códons de sinônimos, podem codificar para o mesmo aminoácido. Quando códons sinônimos estão presentes em uma cadeia, diz-se que a cadeia é degenerada.