Uma molécula é um grupo de dois ou mais átomos ligados entre si, enquanto um composto é um grupo de dois ou mais átomos ligados entre si, onde os átomos são de pelo menos dois tipos de elementos. Todos os compostos também são moléculas, mas todas as moléculas não são compostos.
Por exemplo, a fórmula H2O é uma molécula e um composto, mas H2 é apenas uma molécula, pois contém apenas átomos de hidrogênio. Na química inorgânica, o termo molécula é tipicamente restrito a compostos com carga neutra, enquanto o termo íon se refere a átomos ligados com carga positiva ou negativa.
