A principal diferença entre um sistema de gerenciamento de banco de dados, ou DBMS, e um sistema de gerenciamento de banco de dados relacional, RDBMS, é que os aplicativos DBMS armazenam dados como arquivos, enquanto os aplicativos RDBMS armazenam dados em tabelas. DBMS é propenso a redundância de dados. Em um RDBMS, cada tabela possui um identificador exclusivo conhecido como "chave primária"; isso reduz as instâncias de redundância de dados.
Os dados podem ser armazenados em um SGBD de forma navegacional ou hierárquica. Cada unidade de dados geralmente possui um nó pai e um ou mais nós filhos. O acesso aos dados é mais lento para grandes e complexas quantidades de dados. Os dados e o relacionamento entre os valores dos dados em um RDBMS são armazenados em forma tabular. Isso torna mais fácil e rápido acessar os dados armazenados em um banco de dados relacional. Os dados armazenados no sistema também são logicamente e fisicamente independentes.
Bancos de dados relacionais suportam integridade de dados, recursos avançados de consulta, segurança em bancos de dados e independência estrutural, enquanto DBMS não. O sistema de gerenciamento de banco de dados relacional é uma versão aprimorada do DBMS.
A maioria dos aplicativos de banco de dados é compatível com RDBMS e DBMS. Isso significa que eles podem manter bancos de dados em formato tabular ou relacional e em formato de arquivo. O modelo RDBMS é mais ideal para armazenar grandes quantidades de dados.