Ecossistemas de água doce incluem lagoas, lagos, riachos, rios e pântanos. Água doce significa que o corpo d'água tem uma concentração de sal de menos de 1 por cento. A vida vegetal e animal dos ecossistemas de água doce não sobrevive na água salgada.
Lagoas e lagos variam de alguns metros quadrados a milhares de milhas quadradas. Eles ocorrem em todo o mundo, mas têm uma alta concentração em áreas do hemisfério norte que foram afetadas pelas geleiras da Idade do Gelo. O sol aquece a camada próxima à margem de um lago, a zona litoral. As espécies lá incluem algas e outras plantas, caracóis, larvas de insetos, crustáceos e peixes. As aves aquáticas, cobras e tartarugas da zona litoral alimentam-se deles. A camada superior longe da costa, a zona limnética, é o lar de plâncton e peixes. A zona profunda, a parte mais profunda, é mais fria e abriga heterótrofos, criaturas que comem organismos mortos.
Rios e riachos têm nascentes em nascentes e lagos ou no degelo. Na foz, o rio deságua em outro corpo de água, às vezes outro rio ou um mar ou oceano. A água é mais limpa nas cabeceiras, tem mais oxigênio e mais organismos de água doce, como trutas e heterótrofos. Na foz, onde a água costuma ser turva por causa dos sedimentos, pode haver menos oxigênio e há menos formas de vida diversas e diferentes tipos de organismos, como carpas e bagres. Os organismos também diferem de perto das margens até o meio do rio.
Os pântanos são corpos d'água parados que incluem pântanos, pântanos e pântanos. As espécies de plantas aqui são conhecidas como hidrófitas, que se adaptam à umidade e à umidade. Pássaros, répteis, anfíbios e animais peludos vivem em pântanos. Alguns pântanos são pântanos salgados e não são considerados ecossistemas de água doce.