As placas-mãe ATX e BTX são construídas de forma um pouco diferente, com os slots posicionados em áreas diferentes, e a distância entre a placa-mãe e o gabinete do PC aumentou no BTX. Em termos de layout, a placa-mãe BTX espelha a placa-mãe ATX. O BTX oferece espaço para instalação à esquerda com espaços vazios para cabos à direita, e o ATX é disposto vice-versa.
Em 2004, a Intel anunciou o desenvolvimento da placa-mãe BTX, destinada a substituir o padrão ATX da época. O BTX prometia ventilação interna aprimorada para combater velocidades de clock mais altas e mais componentes que geravam mais calor. A introdução da placa-mãe BTX foi uma tentativa de padronizar os formatos das pequenas placas-mãe.
Devido ao layout e às diferenças estruturais entre as placas-mãe BTX e ATX, elas não podem ser instaladas em caixas intercambiáveis. Além disso, a placa-mãe BTX usa slots PCI Express com um plugue de 24 pinos, enquanto a ATX usa um plugue de 20 pinos.
O ATX foi lançado em 1995, mas levou dois anos para se tornar o padrão. O BTX falhou em alcançar um sucesso de varejo semelhante, em parte devido à falta de interesse do usuário no sistema de resfriamento aprimorado. No entanto, a Dell e a Gateway lançaram produtos BTX.
