De acordo com Boundless, um livro didático e recurso de ensino movido pela nuvem, a principal característica dos fungos e líquenes imperfeitos é um ciclo de vida sexual inclassificável ou ausente. Por esse motivo, eles são considerados "imperfeita." Normalmente, o líquen e os fungos imperfeitos também vivem na terra e têm um micélio, ou massa de hifas, que tem uma aparência de bolor difusa.
Fungos e líquenes imperfeitos estão no filo Deuteromycota; isso significa que eles não têm as estruturas sexuais normalmente necessárias para classificar os fungos. De acordo com a Universidade do Havaí, uma fase assexuada, ou sexual inclassificável, é uma das principais razões para classificar certos fungos e líquenes como imperfeitos. Uma vez que o estágio sexual é determinado, o fungo é reclassificado e colocado na subdivisão apropriada.
Fungos imperfeitos também são polifiléticos, o que indica que eles têm várias origens ancestrais. Em outras palavras, fungos e líquenes imperfeitos são geralmente uma mistura de vários fungos. Isso indica que é difícil determinar de quais fungos eles foram originalmente derivados porque sua informação genética foi recombinada. Por último, fungos e líquenes imperfeitos produzem esporos assexuados sem a ajuda de um esporângio. Eles produzem conidiósporos, ou conídios, que são os esporos unicelulares que ajudam a reprodução dos fungos.