Desvantagens associadas à pesquisa histórica incluem parcialidade, inacessibilidade e incompletude. Como muitos dos artigos ou referências usados não foram originalmente destinados à pesquisa, as informações apresentadas podem ser exageradas na ordem para fornecer detalhes mais interessantes sobre uma conta. Além disso, certos livros ou artigos podem não ter sido preservados e, portanto, podem estar inacessíveis ou incompletos.
A pesquisa histórica pode incluir autobiografias de pessoas famosas ou diários que dão ao escritor uma luz positiva. Portanto, as informações costumam ser baseadas no depoimento de uma testemunha ocular, e não em dados factuais. Além disso, a pesquisa extraída pode conter dados específicos que um pesquisador pode não possuir nem ter experimentado. As cartas, por exemplo, podem pressupor uma boa quantidade de informações anteriores por parte do leitor.
O Roy Rosenzweig Center for History and New Media traça perfis da história digital na web, dizendo que a capacidade de armazenar mídia digital permite um melhor acesso a eventos e informações históricas. A capacidade adicional fornecida por bits e bytes permite que os historiadores acessem vídeos, artigos, imagens e uma variedade de documentos. Como resultado, acadêmicos, educadores e o público em geral podem revisar todos os tipos de dados, dando-lhes assim liberdade para usar mídias mais confiáveis.
