Idealmente, os suportes úmidos não devem ter bolhas de ar porque os iniciantes podem ter problemas para distinguir as bolhas da amostra ao olhar ao microscópio. A presença de bolhas também pode impedir que organismos vivos se movam livremente. Outro problema é que bolhas grandes podem diminuir a resolução de visualização.
Os microscópios usados para visualizar montagens úmidas são projetados para fornecer a resolução da mais alta qualidade quando a amostra está submersa em água. Se uma grande bolha de ar envolver a amostra em vez de água, a qualidade da imagem será reduzida. Outro problema com as bolhas de ar em montagens úmidas é que elas parecem ter um anel escuro em torno de suas bordas sob o microscópio. Este anel escuro pode cobrir uma parte do espécime, dificultando sua visualização.
Certos tipos de espécimes são mais propensos a bolhas de ar do que outros. As bolhas podem facilmente ficar presas sob as amostras que têm a forma de grandes folhas, como fatias de casca de cebola. Espécimes porosos também são propensos a bolhas de ar porque seus poros podem ser preenchidos com ar antes de criar a montagem úmida. Um vácuo é útil para sugar o ar dos poros. Amostras com superfícies gordurosas também formam bolhas de ar facilmente, porque repelem água. Aplicar álcool na amostra para remover a camada de gordura pode ajudar a prevenir bolhas de ar.
