Os pinguins estão em perigo por causa das operações de pesca em grande escala que diminuem seu suprimento de alimentos, caçadores ilegais que roubam seus ovos e matam adultos para obter seu óleo e derramamentos de óleo que poluem seu ambiente e matam milhares de pinguins de uma vez. As populações de pinguins também são ameaçadas pela mudança climática conforme o gelo do mar derrete, removendo suas áreas de alimentação e criadouros.
A mudança climática é a maior ameaça à sobrevivência dos pinguins e a mais difícil de combater; os pinguins são protegidos de danos sob a Lei de Espécies Ameaçadas de 1973 e são resgatados por grupos ambientais durante derramamentos de óleo, mas sua diminuição de habitat e suprimentos de comida cada vez mais difícil para eles se reproduzir ou prosperar. Até mesmo os pinguins fora da Antártica estão ameaçados pelas mudanças climáticas. Os pinguins africanos comem sardinhas e anchovas que seguem as correntes de pequenas ilhas, mas as mudanças climáticas estão fazendo com que os riachos se distanciem das casas dos pinguins e de seus territórios.
Os pinguins também são ameaçados por expedições de pesca comercial. Enquanto alguns pescadores participam dos esforços de conservação e cuidam dos animais feridos de volta à vida, os pinguins ainda precisam competir com os humanos por comida. Os pinguins também enfrentam ameaças de seus predadores naturais: tubarões, baleias assassinas, leões marinhos e focas-leopardo.
