A impressão digital de DNA fornece informações que podem determinar o ponto em que um organismo se separou de sua espécie ancestral, permitindo sua classificação por cladística. A diferença quantificável no DNA entre duas espécies identifica sua distância evolutiva.
A cladística coloca os organismos em clados - árvores genealógicas compostas pela espécie em linha com seus ancestrais e descendentes. Ramificações fora da linha direta tornam-se novos clados. Um cladograma captura essas informações em uma representação gráfica de linhagens e ramificações.
A velocidade com que o sequenciamento de DNA identifica os organismos está esmagando as abordagens tradicionais de taxonomia baseadas em espécies. A cladística posiciona os organismos em um mapa genômico, mas não leva em consideração a evidência de espécies de novos organismos nem o registro de seu perfil genômico. A codificação genética fornece um método para capturar informações genéticas antes que a prova de identificação da espécie esteja disponível. Esses dados atuam como um código de barras biológico, identificando o organismo geneticamente, independentemente das alterações nos sistemas de taxonomia.
Múltiplas fontes de informações existentes e a probabilidade de novos tipos de informações no futuro exigem um sistema capaz de se adaptar às mudanças nas condições. Os novos campos da cibertaxonomia e da informática da biodiversidade estão abordando essas preocupações, construindo um esquema de taxonomia e outros recursos para definições de espécies online. Manter o acesso a recursos online ao longo do tempo é um problema crítico.