A partir de 2015, as evidências sugerem que os probióticos são úteis no tratamento de certos sintomas associados ao Clostridium difficile, mas nem todos os probióticos fornecem os mesmos efeitos, de acordo com o National Institutes of Health. Os cientistas não têm certeza de quais probióticos específicos são benéficos, e os antibióticos costumam ser um tratamento eficaz.
Além disso, os pacientes com uma infecção grave podem não ter diarreia quando o cólon está muito inflamado, explica o National Institutes of Health. Complicações podem ocorrer e podem ser fatais, causando problemas como megacólon tóxico e infecções graves nos ossos ou no coração. O uso de antibióticos é normalmente necessário e, em alguns casos, a condição requer um tratamento mais intensivo, como cirurgia.