A dominância incompleta, também conhecida como dominância parcial, ocorre quando dois alelos produzem proteínas, mas um não funciona da maneira que deveria. Embora em alguns casos essa situação não afete uma pessoa, outras vezes, é a principal causa de defeitos de nascença ou morte infantil.
Esse tipo de expressão gênica pode ser mais difícil de ver em humanos do que em outros organismos. Um exemplo comum usado para mostrar a dominância incompleta é a cor das folhas de snapdragon. Quando os genes de uma flor vermelha e uma branca são colocados juntos, há um gene para flores vermelhas e outro para flores brancas. A expressão de dominância incompleta é vista quando as flores que desabrocham tornam-se rosadas.