Águias pescadoras comem peixe quase exclusivamente, com peixes respondendo por aproximadamente 99 por cento de sua dieta. Águias pescadoras se alimentam de peixes que variam em tamanho de 10,6 onças a 4,4 libras. Eles não comem peixes exigentes e se alimentam de praticamente qualquer tipo de peixe que não seja muito pequeno ou muito grande.
Além dos peixes, as águias pescadoras também se alimentam de outras aves, pequenos répteis, anfíbios, coelhos, lebres e vários roedores ocasionalmente. Devido à sua dieta específica, as águias-pescadoras são mais frequentemente encontradas em áreas próximas a corpos d'água, como lagos, lagoas, rios ou cursos d'água costeiros.
Águias pescadoras caçam pairando sobre a água e, em seguida, pegando peixes rapidamente mergulhando na água com os pés primeiro. Por causa de sua visão aguçada, as águias-pescadoras podem detectar presas subaquáticas a até 40 metros acima da superfície da água.
Águias pescadoras evoluíram e se adaptaram para se tornarem caçadores de peixes altamente eficientes. Suas narinas têm a capacidade de permanecer lacradas enquanto mergulham sob a água, e suas garras têm farpas que impedem a presa de escapar de suas garras. Isso é especialmente importante quando o pássaro está carregando um peixe por uma longa distância. Seus dedos externos podem inverter, e saliências em forma de agulha são usadas para capturar e matar peixes. Para minimizar a resistência do vento, as águias-pescadoras encaram seus peixes para a frente enquanto voam.
