Vários efeitos nocivos do nitrogênio na saúde humana incluem a escassez de vitamina A, a diminuição da função da glândula tireoide e a diminuição da capacidade do sangue de transportar oxigênio. Esses efeitos são observados quando o nitrogênio ocorre na forma de íons, como nitrito ou nitrato.
A diminuição da função tireoidiana e a escassez de vitamina A são causadas por nitrato. O nitrito reage com a hemoglobina no sangue, fazendo com que ele também não transporte oxigênio. Tanto os nitratos quanto os nitratos causam a formação de nitroaminas, que são cancerígenas conhecidas.
Embora haja consequências negativas do nitrogênio, é uma molécula importante dentro do corpo humano que funciona nos sistemas cardiovascular, imunológico e nervoso central e periférico.