A reversão da sequência complementar do DNA é uma questão de convenção. As sequências de DNA são escritas a partir das extremidades 5 '("cinco primos") a 3' ("três primos"), mas se a sequência complementar for escrita oposta à sequência de DNA original, ela vai das extremidades 3 'a 5'.
Esta técnica também pode ser usada para determinar o mRNA que é transcrito de um trecho específico de DNA codificador. A única diferença é que, ao escrever uma sequência de RNA, o T, timina, é substituído por U, uracila. Normalmente, a sequência de RNA é idêntica à codificação, ou "sentido", fita de DNA, com exceção de U em vez de bases T.
DNA complementar, ou cDNA, também pode se referir a uma fita de DNA que é sintetizada com base em uma sequência de mRNA que foi removida de uma célula ou organismo. A síntese de cDNA a partir de mRNA é usada em técnicas de biologia molecular para permitir trabalhar apenas com o DNA que codifica para a sequência da proteína, ao invés dos íntrons da proteína.