Os micróbios são úteis para os humanos de inúmeras maneiras. Os membros desse grupo de organismos estão envolvidos em atividades humanas que vão desde a produção e teste de medicamentos até o cultivo, preparação e digestão de alimentos. O estudo científico dos micróbios enriquece a compreensão da humanidade sobre a genética, as doenças e outros aspectos da vida no planeta Terra.
Os micróbios ajudam os humanos diretamente de várias maneiras. Alguns micróbios produzem compostos medicinais ou bioativos, como o antibiótico penicilina, que é naturalmente derivado de um tipo de fungo. Outros micróbios são usados para fermentar vegetais, grãos e laticínios para fazer picles, pão, álcool, iogurte e queijo. Os cientistas usam micróbios como organismos modelo e ferramentas vivas em laboratório, e o uso de micróbios para estudar a genética humana, a bioquímica e as doenças revolucionou a compreensão humana do mundo biológico. Os micróbios também são usados para realizar etapas essenciais em processos industriais, como a recuperação de águas residuais.
A atividade microbiana natural também confere vantagens indiretas à humanidade. A decomposição da matéria orgânica e a reciclagem de nutrientes nos ecossistemas agrícolas e naturais são realizadas por micróbios. Os micróbios também são responsáveis pela fixação do nitrogênio atmosférico, o que aumenta a fertilidade do solo nesses sistemas. Comunidades microbianas de ocorrência natural também ajudam a controlar a disseminação de patógenos vegetais e animais e a limitar o tamanho das populações de insetos-praga. Em última análise, os micróbios são responsáveis por regular a maioria dos sistemas globais que tornam a Terra hospitaleira para a habitação humana.