O safranin é usado como corante para têxteis e como corante para vários procedimentos científicos. Os procedimentos científicos que envolvem a safranina incluem contracoloração de Gram, contracoloração de endosporo, detecção de grânulos e indicação de redox.
A safranina é um corante vermelho solúvel em água também conhecido como fenosafranina, vermelho básico 2 e safranina 0. É capaz de manchar todos os núcleos celulares de vermelho. A safranina está disponível como dimetil ou trimetil safranina, que são basicamente idênticos em comportamento e aparência.
A safranina é comumente usada na coloração de Gram, o que ajuda a distinguir entre grupos de bactérias Gram-positivas e Gram-negativas devido à composição da parede celular. Ambos os grupos são primeiro tingidos com um corante violeta cristal solúvel em água e iodo é adicionado à solução. Álcool etílico ou acetona é então adicionado, o que faz com que as bactérias Gram-positivas retenham o corante violeta cristal e as bactérias Gram-negativas descartem o corante violeta cristal. Em seguida, a safranina é adicionada como contracoloração para as bactérias, manchando as bactérias Gram-negativas de vermelho. As bactérias Gram-positivas permanecem violetas.
As paredes celulares das bactérias Gram-positivas contêm uma espessa camada de peptidoglicano, que permite que as bactérias retenham a coloração violeta de cristal. As bactérias Gram-negativas retêm a coloração de safranina em vez da coloração violeta devido às suas paredes celulares de peptidoglicano mais finas.