Os cientistas não têm certeza dos movimentos corporais exatos envolvidos na cópula do estegossauro porque não há exemplos modernos disponíveis; no entanto, eles têm várias teorias baseadas nos descendentes vivos dos dinossauros. Certamente o macho não montou a fêmea como a maioria das espécies animais. Em vez disso, é possível que deitem de barriga com barriga, ou a mulher deitada enquanto o homem fica ao lado dela. Os cientistas até sugerem que eles podem ter ficado lado a lado.
É um fato conhecido que os dinossauros, incluindo o estegossauro, botam ovos. Biologicamente, então, o tempo necessário para a reprodução era mínimo, embora eles precisassem ter intimidade física real, ao contrário dos peixes. Em vez disso, como os pássaros modernos, é possível que uma pequena quantidade de esperma depositada na fêmea possa fertilizar os óvulos por várias semanas.
Uma vez que nenhum tecido mole preservado ou impressões de tecido mole foram localizados de qualquer dinossauro nesta época, é impossível saber como essas criaturas muito ósseas e espinhosas se reproduziram. Como os porcos-espinhos e ouriços modernos, porém, está claro que eles se reproduzem por milhares de anos. A natureza sempre encontra um caminho, e é possível que os órgãos genitais masculinos e femininos tenham sido especialmente moldados para permitir que o processo ocorra sem muitas dificuldades.
