De acordo com o Merriam-Webster Dictionary, "não patogênico" significa que um organismo não causa doenças, então bactérias não patogênicas não causam doenças. Algumas bactérias são úteis em seus ambientes.
Por exemplo, o trato digestivo humano contém bactérias que o ajudam a funcionar corretamente. Essas bactérias não apenas auxiliam no processo digestivo, mas também matam bactérias patogênicas. As bactérias são utilizadas na produção de certos laticínios, como queijo, creme de leite e iogurte. No mundo natural, algumas bactérias funcionam como decompositores, decompondo organismos mortos. Outros tipos de bactérias consomem óleo, e essa tendência natural é mais visível durante derramamentos ou vazamentos de óleo.
