Vários tipos de animais vivem dentro ou ao redor do Mar do Caribe, incluindo pássaros, répteis, baleias, anfíbios e tubarões. O Caribe é o lar de criaturas ameaçadas de extinção, bem como daqueles que vivem em abundância.
De janeiro a março é a melhor época para ver as baleias jubarte e seus bebês. O Mar do Caribe abriga a segunda maior barreira de recifes do mundo, onde mergulhadores e amantes da natureza encontrarão milhares de espécies como o espigão azul, a donzela amarela, a moreia verde e o tubarão-lixa. É possível que os turistas interajam com essas e outras espécies.
O Mar do Caribe também é o lar de algumas criaturas muito perigosas. O polvo de anéis azuis tem um veneno poderoso que pode matar 30 humanos em minutos. O coral de fogo causa fortes dores, náuseas e vômitos. O peixe-pedra é um dos peixes mais venenosos do mundo, com nadadeiras afiadas como navalhas.
Algumas das criaturas mais ameaçadas do mundo podem ser encontradas no Caribe. Isso inclui o sapo chamado Coqui llanero, o lagarto de terra St. Croix, o peixe-boi das Índias Ocidentais e a boa porto-riquenha. Existem atualmente quatro anfíbios, 11 répteis, nove pássaros e um mamífero que estão em perigo de extinção e vivem na área.