A zona crepuscular, também chamada de zona mesopelágica, é o lar de muitas espécies de lulas e polvos, bem como de alguns peixes bioluminescentes, incluindo o peixe machado. Alguns animais semelhantes a águas-vivas, chamados ctenóforos e sifonóforos, também vivem na zona.
A zona crepuscular não tem nenhuma planta porque a escuridão da água impede a fotossíntese. Os animais que vivem lá devem ser fortes o suficiente para suportar temperaturas mais frias e pressão da água mais forte do que os animais que vivem perto da superfície. Os peixes da zona crepuscular, incluindo o peixe víbora e o peixe dragão, tendem a ter corpos mais pesados porque, ao contrário dos peixes de superfície, não precisam nadar rapidamente. Eles costumam ter dentes e bocas grandes porque suas presas podem ser maiores do que eles.
Alguns animais viajam em águas rasas às vezes. Isso inclui peixes maiores, como espadarte, tubarões-gato e chocos. Vários tipos de enguias, incluindo enguias-lobo e narcejas, também podem ser encontrados na zona mesopelágica. Alguns herbívoros podem se aventurar na zona mesopelágica às vezes, mas não permanecem lá por falta de comida. Os animais que vivem lá na maior parte do tempo são carnívoros ou animais que sobrevivem de resíduos, como pelotas fecais e organismos mortos, que afundam na zona do crepúsculo. Esses animais são chamados de detritívoros.