As cobaias geralmente têm entre um e quatro bebês, ou filhotes, em cada ninhada, de acordo com o lince-da-índia. No entanto, em raras ocasiões, uma cobaia mãe, também chamada de porca, pode ter sete ou mais filhotes em uma ninhada.
O período de gestação das cobaias dura entre 59 e 73 dias. As porcas tornam-se sexualmente maduras e capazes de procriar por volta das quatro semanas de idade, e são capazes de engravidar novamente poucas horas após o parto. Por causa disso, é recomendado que todos os porquinhos-da-índia machos, também chamados de javalis, sejam removidos de uma gaiola contendo uma nova mãe porquinho-da-índia e sua ninhada.