As colônias do meio acomodavam uma mistura diversificada de religiões que incluíam quacres, luteranos, presbiterianos, amish, congregacionalistas e judeus. Por causa de vários mestres coloniais na área, as tradições religiosas de muitos países europeus existiam em a área. As colônias intermediárias incluíam Nova York, Nova Jersey e Pensilvânia.
Talvez a mais tolerante das colônias intermediárias fosse a Pensilvânia. Foi fundado por William Penn, um quacre proeminente que o imaginou como um refúgio não apenas para os quacres, mas para pessoas de todas as minorias religiosas perseguidas. A Pensilvânia atraiu colonos de muitas tradições religiosas, incluindo menonitas e amish, que ainda contribuem para a diversidade da paisagem religiosa da região. As outras colônias também eram diversas, mas nenhuma delas tão ativamente quanto a Pensilvânia.
