O clima dos biomas de água doce varia dependendo do tipo de ecossistema; lagoas e lagos têm temperaturas moderadas com variações sazonais, enquanto pântanos geralmente existem em áreas mais quentes e úmidas. Alguns corpos d'água maiores em biomas, como lagos e grandes lagoas, influenciam a temperatura do ar circundante e os níveis de umidade por meio do calor cíclico e calor a energia no ar circundante. Outros, como pequenos rios e riachos, derivam influência de seus ambientes, mudando na forma física e na temperatura dependendo das condições locais.
O clima em biomas de água doce varia com as estações e a localização geográfica. Algumas lagoas e lagos ocorrem sazonalmente, preenchendo leitos naturais com amplas chuvas de primavera e verão. A umidade extra evapora no ar, moderando as temperaturas e produzindo condições locais como neblina e neblina. A temperatura da água nesses corpos aquáticos varia com as estações, mudando a composição física. Água mais fria forma gelo em alguns lagos e lagoas durante o inverno, reduzindo a atividade dos organismos internos.
A temperatura e as condições dos riachos e rios variam, oscilando com as estações e a localização. Fontes de fluxo, que muitas vezes puxam água das profundezas da Terra, apresentam temperaturas mais frias do que bocas. Riachos e rios aparecem em todo o mundo, existindo em climas frios do norte, em condições moderadas e em locais quentes e úmidos.
