Um dos objetivos que as organelas ligadas à membrana servem é permitir o isolamento e a concentração de enzimas e reagentes em um pequeno espaço. Isso permite que as reações químicas em uma célula ocorram mais rapidamente e com maior eficiência. As organelas ligadas à membrana também podem confinar proteínas e moléculas prejudiciais do resto da célula.
O lisossoma é um exemplo de organela ligada à membrana que ajuda a proteger a célula de proteínas e moléculas prejudiciais por meio do confinamento. A organela é o lar de várias enzimas envolvidas na digestão de lipídios, proteínas e ácidos nucléicos. Embora essas enzimas tenham uma função importante dentro do lisossoma, elas podem destruir lipídios, proteínas e ácidos nucléicos se liberados no fluido intracelular, chamado citosol, causando a morte da célula. A presença da membrana que envolve o lisossoma impede que isso ocorra, mantendo as enzimas dentro da organela.
Alguns outros exemplos de organelas ligadas à membrana incluem mitocôndrias, o aparelho de Golgi e o retículo endoplasmático. As mitocôndrias possuem duas membranas cada, com a membrana interna dobrando-se em cristas. Essas cristas servem como locais de geração de trifosfato de adenosina, ou ATP. O aparelho de Golgi é responsável pelo processamento de proteínas fabricadas no retículo endoplasmático. O retículo endoplasmático é a área da célula onde os lipídios, a maioria das membranas celulares, proteínas secretadas e proteínas transmembrana são produzidos.