Os fungos são estruturados em filamentos chamados hifas, que são constituídos por cadeias de células e separadas umas das outras por septos ou paredes cruzadas. Muitas dessas hifas agrupadas formam o micélio.
Os septos, ou paredes transversais, entre cada filamento são crivados de poros, permitindo o fluxo e transporte de nutrientes através do fungo. Embora a maioria dos fungos seja composta de filamentos de hifas formando uma estrutura de micélio, as hifas cenocíticas são separadas por paredes.
Uma célula fúngica é composta por um núcleo e organelas. Assim como as plantas, as células dos fungos são circundadas por paredes celulares, mas as paredes celulares não possuem cloroplastos, que são as unidades nas quais ocorre a fotossíntese, porque os fungos não se alimentam do sol. As paredes celulares são compostas por quatro componentes: quitina, glucanos, proteínas e melanina. A quitina é composta por fios de açúcar unidos para formar um padrão forte na parede. As glucanas também são feitas de açúcar aglomerado, mas têm uma forma mais flexível. A melanina ajuda a fortalecer a parede celular e também a proteger o fungo dos danos do sol. Algumas das proteínas retêm água dentro das células, protegendo o fungo da desidratação.