A principal desvantagem da transmissão por micro-ondas é que as torres de micro-ondas só podem trocar dados se tiverem uma linha de visão desimpedida entre elas, sem obstáculos como prédios, morros ou árvores no caminho. Outras desvantagens incluem absorção de sinal pela atmosfera, interferência climática e despesas.
Os sinais de micro-ondas geralmente viajam em linha reta de um transmissor a um receptor. Se os sinais passam por regiões de ar com densidades diferentes, como passam ao cruzar um corpo de água, os sinais se curvam ligeiramente. Em vez de chegar ao receptor, alguns sinais são absorvidos pela atmosfera e os sinais perdidos afetam a qualidade da transmissão. Os sinais de microondas também podem ser afetados por chuva forte, granizo e neve. As gotas de chuva e granizo, em particular, têm quase o mesmo tamanho que os comprimentos de onda de um microondas de alta frequência. Uma tempestade pode bloquear a comunicação por microondas, criando um problema chamado desvanecimento da chuva. Outra desvantagem da transmissão por microondas é o custo das torres, que são caras de construir.
Uma vantagem da transmissão por microondas é que, em vez de usar cabos ou outros fios físicos, ela usa ondas eletromagnéticas com pequenos comprimentos de onda. O tamanho dos comprimentos de onda permite que um transmissor direcione as microondas para um receptor em um feixe estreito, melhorando a eficiência. Além disso, a alta frequência das microondas significa que um feixe de microondas tem uma capacidade de transporte de informações muito grande.
