As enzimas são classificadas em seis tipos: oxidorredutases, transferases, hidrolases, liases, isomerases e ligases. A classificação da enzima é baseada na reação química que a enzima catalisa.
As enzimas classificadas como oxidorredutases realizam reações de oxidação e redução, em que um substrato é oxidado e outro é reduzido. As transferases movem grupos funcionais de uma molécula para outra. As hidrolases quebram ligações simples entre os átomos ao adicionar uma molécula de água. As liases transferem grupos amino, água ou amônia para formar ou remover uma ligação dupla dentro de uma molécula. As isomerases mudam a posição dos grupos funcionais para que o substrato e o produto sejam isômeros um do outro, o que significa que eles contêm o mesmo número de átomos. Por último, as ligases catalisam reações químicas por meio da remoção de uma molécula de água para criar ligações simples.