Um CD-R de 99 minutos e 4,7 polegadas (12 cm) pode conter até 999,3 megabytes de dados. Os CD-Rs vazios de 99 minutos, no entanto, não são tão populares como o disco padrão de 74 minutos e 670 MB devido a problemas de gravação e leitura associados ao anterior.
Embora diferentes CD-Rs sejam comercializados com uma capacidade máxima de armazenamento de dados declarada, geralmente é possível gravar mais ou "sobregravar" dados no disco além da capacidade declarada. Isso ocorre porque a capacidade de armazenamento de dados dos CD-Rs é medida pelos dados de áudio padrão do Red Book, que faz uma cota para 90 segundos de silêncio digital.
A área silenciosa ou em branco é chamada de "lead out" e está incluída na maioria dos CD-Rs junto com outras áreas padrão, como a lead-in e a área do programa. Essa mesma área em branco pode ser utilizada para gravar dados adicionais no disco em uma sessão de gravação de CD.
O disco multi-sessão, por outro lado, perde espaço de armazenamento de dados disponível com cada sessão de gravação de dados. Na primeira sessão de gravação, aproximadamente 23 megabytes de dados são perdidos. As sessões de gravação de dados subsequentes resultarão na perda de 14 megabytes de espaço de armazenamento em cada sessão.
Algumas unidades de CD-R também usam técnicas especiais para gravar mais dados no CD-R. No entanto, os dados gravados no CD-R podem não ser compatíveis e legíveis em outros leitores de CD-R padrão.