Os sistemas de reconhecimento de caracteres com tinta magnética oferecem altos níveis de segurança porque os caracteres MICR são escritos com tinta de óxido de ferro e seguem um formato rígido, o que torna virtualmente impossível a falsificação; no entanto, esses sistemas especializados são caros e só podem ser usados para ler fontes MICR escritas em formatos específicos. Os cartuchos usados em impressoras MICR também são mais caros em comparação com outros cartuchos de toner.
Outra vantagem importante do reconhecimento de caracteres com tinta magnética é que ele tem uma pequena taxa de erro de leitura. Os scanners MICR são desenvolvidos para decifrar caracteres com precisão, desde que sigam os padrões estabelecidos pela American Bankers Association, ABA, e American National Standards Institute, ANSI.
Esses padrões são bastante elevados e podem ser difíceis de alcançar, o que pode ser uma desvantagem distinta para algumas instituições. ANSI gerencia e implementa todos os padrões de impressão; se as fontes MICR não atenderem aos padrões definidos, elas causarão erros de processamento e serão rejeitadas em bancos e outras instituições.
A tecnologia de reconhecimento de caracteres de tinta magnética é usada principalmente por bancos para verificar a validade de cheques; algumas companhias aéreas os utilizam para validar passagens aéreas. Os caracteres e números são normalmente encontrados na parte inferior dos cheques. As impressoras a laser que usam toners MICR são usadas para imprimir os caracteres de tinta magnética.