Existem várias desvantagens no sistema POS, incluindo o aumento da dificuldade de ensinar o sistema e custo. Os sistemas POS são geralmente mais populares hoje do que antes, mas muitas lojas ainda dependem de uma caixa registradora devido a custo e eficiência.
Uma caixa registradora tem menos componentes do que um sistema POS, o que significa que é menos provável que possa ser usada para folha de pagamento, dados do trabalhador, manutenção de registros e outras operações normais de negócios. Por causa disso, a caixa registradora é muito mais fácil de aprender. Existem menos maneiras de cometer erros e não há tantos programas com que se preocupar na máquina.
Os proprietários de pequenas empresas podem começar com uma caixa registradora e evitar mudar para um sistema de POS. Isso porque o custo é um fator importante para quem procura caixas registradoras em vez de sistemas POS. Uma nova caixa registradora costuma ser mais barata do que um novo sistema de POS e, quando isso é combinado com os custos extras de treinamento, pode resultar em lojas que optam por uma configuração baseada em caixa registradora.
Outros podem simplesmente não precisar de todos os recursos do sistema POS. Se a folha de pagamento for feita em papel ou as vendas forem processadas todas as noites pela equipe, isso pode fazer o sistema POS parecer muito caro para os benefícios adicionais que não são necessários.