Durante a primeira fase da dieta Atkins, indução, quem está fazendo dieta pode comer uma quantidade razoável de carne, frango, peixe, ovos, manteiga e óleos vegetais. Ele deve se limitar a 20 gramas de carboidratos líquidos de vegetais como brócolis, feijão verde, aipo, aspargos e pimentões.
Durante a indução, quem está fazendo dieta não pode comer nenhum alimento que contenha açúcar refinado ou farinha, incluindo pão e macarrão. Ele também evita vegetais com amido, grãos, nozes e sementes, legumes como feijão e ervilha, e cafeína e álcool. O objetivo durante esta fase é forçar o corpo a queimar gordura em vez dos carboidratos que ele normalmente usa como combustível. Essa fase dura no mínimo duas semanas.
A próxima fase é o equilíbrio. Nesse estágio, quem está fazendo dieta começa a adicionar pequenas quantidades de alimentos ricos em nutrientes que contêm carboidratos, como frutas vermelhas, vegetais, nozes e sementes. A variedade de alimentos consumidos continua a aumentar durante a terceira fase, a pré-manutenção, que começa quando a pessoa que faz dieta está a 5 quilos de seu peso ideal. Durante a pré-manutenção, quem está fazendo dieta pode adicionar até 10 gramas de carboidratos líquidos por semana até encontrar o ponto em que a perda de peso é interrompida. Se ele ainda estiver aquém da meta de peso nesse ponto, ele corta os carboidratos até atingir sua meta. A fase final é a manutenção, que dura toda a vida e visa ingerir a quantidade de carboidratos que permite ao dieter manter um peso saudável.