Uma vantagem dos animais geneticamente modificados é que eles crescem mais rápido e maiores do que os animais naturais, e podem produzir com mais eficiência, de acordo com o Centro Histórico Animal e Legal da Universidade Estadual de Michigan. Uma desvantagem de alterar geneticamente os animais é que diminui a diversidade genética da espécie, tornando a espécie mais vulnerável a novos tipos de doenças infecciosas.
A capacidade de deletar genes de estresse em animais e torná-los não sencientes é uma possível vantagem dos animais geneticamente modificados, observa a Michigan State University. Isso torna o animal incapaz de sentir dor e potencialmente elimina o sofrimento imposto durante uma vida industrial. Alguns podem considerar isso uma desvantagem, pois pode piorar as condições nas fábricas para os animais e aumentar seu sofrimento. Os defensores da engenharia genética também consideram imoral roubar a sensibilidade de um animal.
Animais geneticamente modificados podem resistir melhor a doenças conhecidas, como câncer de mama hereditário, informa a Michigan State University. Isso permite que os cientistas pesquisem certas doenças com mais precisão, de maneira mais rápida e econômica. Outra vantagem é que os cientistas podem criar animais geneticamente para produzir proteínas humanas complexas, que são usadas para criar novas drogas terapêuticas. Este método de produção de proteínas humanas complexas é mais barato, mais fácil de fabricar e produzir em massa e pode resultar em menos sacrifício de animais do que os métodos tradicionais.
Animais geneticamente alterados podem dizimar populações selvagens da mesma espécie se os animais modificados escaparem para a natureza, afirma a Michigan State University. Eles também podem prejudicar o meio ambiente.