Algumas desvantagens de trabalhar em equipe incluem o potencial de conflito entre os membros da equipe, alguns membros não sendo compatíveis com outros membros e dividir o trabalho pode consumir muito tempo. Embora geralmente seja trabalho em equipe dentro de uma empresa é visto como algo positivo, às vezes pode ser contraproducente.
Quando a gerência está considerando a formação de uma equipe para trabalhar em um projeto dentro da empresa, a primeira consideração deve ser se os membros da equipe trabalharão bem juntos. Por exemplo, se houver um conflito conhecido entre dois ou mais membros, colocá-los na mesma equipe pode não dar os resultados desejados. Quando há conflito entre os membros da equipe, o trabalho em equipe não será tão eficiente.
A gerência também deve considerar o quão bem os membros da equipe em potencial trabalham com os outros. É natural que algumas pessoas tendam a produzir trabalhos de melhor qualidade sozinhas, enquanto outras prosperam ao mesmo tempo em que conseguem fazer um brainstorm com seus colegas de trabalho. Se um funcionário for solitário, é provável que ele não seja adequado para uma equipe.
Às vezes, o velho ditado de "muitos chefs estragam a sopa" é verdadeiro e pode ser aplicado em alguns casos ao trabalho em equipe. Ao considerar a formação de uma equipe, a gerência também deve pensar se ela será econômica. Às vezes, muitas pessoas trabalhando em um projeto tendem a turvar as águas em vez de tornar as coisas mais claras e simplificadas.