Alguns protistas têm paredes celulares, mas outros não. Protistas com paredes celulares incluem diatomáceas fotossintéticas, algas vermelhas e algas verdes, junto com o Oomycota, semelhante a um fungo. A maioria dos outros protistas, como algas marrons e protistas semelhantes a animais, não.
Diferentes grupos de protistas têm paredes celulares compostas de diferentes materiais. Algas verdes e Oomycota têm paredes celulares feitas, pelo menos parcialmente, de celulose, como as que cercam as células vegetais. As algas vermelhas também têm celulose em suas paredes celulares, mas as paredes também contêm carbonato de cálcio. As diatomáceas, que são o principal componente da terra de diatomáceas, têm paredes celulares feitas de sílica.
