Com exceção do peixe pulmonado, os peixes não têm pulmões. Em vez disso, eles possuem guelras. O peixe pulmonado tem pulmões menores do que outros animais e não pode usá-los para respirar fora da água como os outros animais fazem.
Os peixes absorvem oxigênio em seus sistemas movendo a água através de suas guelras. O sistema circulatório de um peixe passa grandes quantidades de sangue desoxigenado próximo à água, movendo-se pelas guelras. O oxigênio presente na água é então absorvido pelos capilares na corrente sanguínea, permitindo que os peixes respirem.
Os peixes pulmonares não "respiram" da mesma forma que os animais terrestres. Seus pulmões são alveolados por capilares e funcionam da mesma forma que as guelras. A água passa perto deles e o oxigênio é absorvido pela corrente sanguínea.