Alguns lagartos hibernam, dependendo da espécie, do clima de seu habitat natural e do clima. A hibernação em lagartos é uma adaptação que permite que sobrevivam a baixas temperaturas, apesar de serem ectotérmicos ou frios de sangue, criaturas.
Muitas espécies de lagartos que vivem em climas temperados hibernam para sobreviver ao frio, pois sem calor ambiente suficiente, seus processos metabólicos ficam mais lentos. Sem hibernação, essa desaceleração pode ser mortal. Durante a hibernação, seu metabolismo muda para conservar drasticamente a energia, então a desaceleração metabólica a partir de baixas temperaturas é menos perigosa. É um processo gradual que é impulsionado por várias semanas sucessivas de temperaturas mais baixas à medida que o corpo do lagarto se transforma em modo de hibernação. Lagartos são muito propensos à hipotermia, e seu tecido corporal pode morrer se não forem suficientemente preparados.
Algumas espécies de lagartos que hibernam incluem anoles verdes, lagartos com chifres e lagartos de dedos franjados. As espécies tropicais não podem hibernar, pois não evoluíram adaptações às condições frias.