Os aminoácidos de forma livre não contêm ligações peptídicas, pois são os blocos de construção monoméricos das proteínas. Conforme explicado pelo Dr. John W. Kimball, ligações peptídicas se formam entre dois aminoácidos, criando longas cadeias polipeptídicas. As proteínas são compostas por uma ou mais dessas cadeias polipeptídicas.
Vinte aminoácidos diferentes são usados para sintetizar proteínas. Os aminoácidos consistem em um átomo de carbono alfa central, átomo de hidrogênio, grupo carboxila, grupo amino e um grupo funcional que determina o tipo de aminoácido. Kimball explica que durante a síntese de proteínas, uma ligação peptídica covalentemente ligada é formada entre o grupo carboxila de um aminoácido e o grupo amino do próximo aminoácido sequencial.