A polinização da água ocorre quando o pólen passa pela água para entrar em contato direto com as flores, permitindo que certas plantas se reproduzam. Plantas que utilizam esse tipo de polinização são ervas daninhas aquáticas e ervas daninhas de lago, de acordo com o Serviço Florestal dos EUA . O nome técnico da polinização da água é hidrofilia de superfície.
A polinização da água funciona devido às correntes de água que transportam o pólen nos rios ou lagos. As flores liberam pólen e os grãos flutuam passivamente para outra flor. Às vezes, o pólen vai debaixo d'água para germinar. Este método altamente complicado de reprodução opera com plantas com flores da mesma espécie. As flores precisam produzir muito pólen para aumentar suas chances de reprodução da planta.
A polinização por água é rara, pois a maioria das plantas com flores fertiliza as flores com insetos ou o vento. Nos Estados Unidos, as plantas polinizadas pela água são consideradas invasivas, visto que essas plantas são normalmente encontradas na Austrália. Plantas que usam água para polinização não precisam gastar muita energia produzindo cores ou cheiros brilhantes para atrair insetos para reprodução.
A polinização torna uma semente geneticamente única nas flores para garantir a diferenciação. Dessa forma, a descendência da planta tem uma chance maior de sobreviver a mudanças ambientais drásticas. Uma melhor diferenciação ao longo do tempo leva a uma melhor seleção evolutiva em grandes populações.