A fragmentação do habitat ocorre quando um habitat é alterado ou desarticulado. Como resultado, há uma separação espacial em um habitat que redistribui as espécies e organismos dentro do habitat.
A fragmentação do habitat pode ocorrer naturalmente ou como resultado de humanos. Naturalmente, as geleiras, a atividade vulcânica, os movimentos das placas tectônicas, o aumento do nível do mar e as mudanças climáticas podem causar a fragmentação e a desarticulação dos habitats. Essas ocorrências podem fazer com que pequenos habitats, como habitats de microrganismos, mudem drasticamente ou podem afetar um habitat maior, como uma grande massa de terra. Os humanos também causam a fragmentação do habitat construindo novos edifícios, alterando paisagens e derrubando ou plantando árvores.
