Embriologia comparativa é o estudo científico das semelhanças na estrutura entre os embriões de várias espécies que sugerem uma possível ligação com um ancestral comum. Os primeiros padrões de desenvolvimento são coletados e comparados para investigar as relações prováveis entre organismos evoluídos.
Os cientistas determinaram que o embrião passa por uma série de processos evolutivos antes de se tornar a forma atual de uma espécie. Apesar das diferenças pronunciadas de vários organismos em seus estados adultos, os embriologistas comparativos afirmam que os embriões desses organismos geralmente contêm as mesmas características estruturais de seu ancestral comum. Através de uma série de estágios evolutivos, essas estruturas anatômicas ancestrais desaparecem gradualmente à medida que o organismo se desenvolve e amadurece.