Devido às suas cascas duras e peles grossas, as tartarugas adultas do deserto são presas apenas por leões da montanha. As tartarugas jovens do deserto são muito mais vulneráveis e também são comidas por raposas kit, coiotes, cães selvagens, raposas cinzentas, linces, texugos, corvos, corredores de estradas e monstros Gila.
As tartarugas do deserto fêmeas protegem seus ovos vulneráveis por um tempo, mas uma vez que eclodem, as tartarugas jovens precisam confiar em sua coloração enigmática para sobreviver. As tartarugas do deserto se abrigam em tocas quando não estão em busca de comida ou companheiras, e são escavadeiras hábeis. Como último recurso, tartarugas do deserto de todas as idades urinam para se tornarem menos palatáveis para predadores em potencial.