Louis Pasteur finalmente refutou a geração espontânea por meio de um experimento em que caldo de carne foi esterilizado por fervura em dois frascos, um exposto ao ar e outro protegido dele. Aquele que foi exposto contaminantes turvados, mostrando crescimento microbiano, enquanto o selado não.
Louis Pasteur é famoso por suas contribuições para a compreensão das doenças e dos micróbios em geral. O processo de pasteurização, em que leite, vinho e outros insumos são tratados para impedir a contaminação bacteriana, foi descoberto e batizado em sua homenagem. Pasteur foi o primeiro a mostrar que a fermentação é causada por microrganismos e que o oxigênio não é necessário para este processo.
Pasteur não originou a teoria dos germes, mas foi ele quem forneceu evidências experimentais suficientes para convencer a maioria da comunidade científica de que era verdade. Ele também foi o primeiro a expor os princípios da vacinação e criou as primeiras vacinas contra a raiva e o antraz. Ele descobriu esses princípios após um acidente enquanto estudava a cólera das galinhas, normalmente uma doença fatal. Ele tratou as galinhas com uma cultura bacteriana estragada, que produziu apenas sintomas leves. Depois disso, ele não conseguiu reinfectar as galinhas, mesmo com bactérias viáveis.
