Os nenúfares se reproduzem por sementes e por novas plantas que brotam das raízes grandes e espalhadas, que são caules subterrâneos chamados rizomas. As pétalas circundam as partes reprodutivas masculinas e femininas. As pétalas ficam abertas apenas durante o dia por três dias.
Na primeira manhã, as pétalas abrem e as flores produzem um fluido no centro em forma de taça, após o que estão prontas para receber o pólen de outras flores. Os insetos cobertos de pólen são atraídos pelo cheiro adocicado e caem no líquido ao entrar na flor. O líquido lava o pólen de seus corpos para as partes das flores femininas, que são chamadas de estigmas, causando a fertilização. Depois de três dias, os nenúfares enrolam seu caldo e vão para a água, e as sementes amadurecem durante esse período. As sementes são liberadas debaixo d'água após várias semanas.