Como um iodóforo, combinado com uma solução solubilizante ou transportador, acredita-se que o iodo exiba propriedades desinfetantes porque penetra nas paredes celulares de um organismo e interrompe a estrutura e síntese de proteínas e ácidos nucléicos. Essas soluções são úteis como desinfetantes e anti-sépticos.
As soluções de iodo são usadas em uma variedade de ambientes onde ação anti-séptica ou desinfetante é necessária. Em ambientes de saúde, eles são usados para desinfetar equipamentos, como frascos de hemocultura, termômetros, tanques de hidroterapia e endoscópios.
As soluções de iodóforo não são recomendadas como desinfetantes de superfícies duras devido às diferenças de concentração. Eles também não são recomendados para uso com cateteres de silicone devido ao potencial de romper o material.