Um frasco anaeróbico funciona quando um indivíduo coloca água, borohidreto de sódio, bicarbonato de sódio e ácido cítrico em um frasco selado junto com alguns microrganismos. As soluções reagem devido a um catalisador de paládio para formar hidrogênio, carbono dióxido e condensação, usando o oxigênio para criar um ambiente anaeróbio ou sem oxigênio.
Como o frasco não contém oxigênio, apenas certos tipos de microrganismos podem prosperar e crescer, como os anaeróbios. Aeróbios, que requerem oxigênio para viver, morrerão neste ambiente.
Para fazer um frasco anaeróbico ou sistema anaeróbio GasPak, um indivíduo precisa de um frasco de policarbonato, um envelope GasPak, uma tampa com uma gaxeta, uma tira de azul de metileno, uma bolsa de malha com o catalisador de paládio, placas inoculadas que contêm o microrganismos e os produtos químicos necessários. Ele primeiro adiciona o borohidreto de sódio, bicarbonato de sódio, ácido cítrico e água à bolsa GasPak que é então colocada no frasco. Ele também coloca os microorganismos na jarra. Depois de selar o frasco com a tampa, ele aguarda a reação química.
Os produtos químicos e a água formam o hidrogênio e o dióxido de carbono. O hidrogênio então reage com o oxigênio do ar, resultando em condensação. Isso remove todo o oxigênio do frasco, tornando a faixa azul de metileno branca para mostrar a falta de oxigênio e dando aos microorganismos um ambiente para crescer.