A raça com a qual um chihuahua é misturado é desconhecida. Existem muitas idéias sobre a origem da raça, mas não há prova de que alguma seja verdadeira.
Alguns acreditam que a raça veio da região da América do Sul e Central e foi desenvolvida através da criação do cão Techichi. Outros acreditam que o Chihuahua se originou na China e foi importado para os Estados Unidos, onde foi criado com cães nativos menores. Outros ainda acreditam que a raça foi derivada da raposa Fennec, nativa da África do Sul.
Mesmo com evidências de que os chihuahuas existem desde os tempos antigos, dizem que se originou no México e recebeu esse nome em homenagem ao estado de Chihuahua, localizado naquele país.